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涂抹法又称涂擦法，即在水产动物体表患处涂抹较浓的药液或药膏，以杀灭病原体；此法用药量少，安全、副作用小，但适用范围小；此法适用于治疗繁殖个体、名贵水产动物体表疾病。
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浸洗法即应先放浸洗对象，再配制药液。
涂抹药物时应注意将头部稍提起，以免药物流入口腔、鳃而产生危害。
口服法又称投喂法，即将药物或疫苗与水产动物喜欢吃的饵料拌匀后直接投喂或制成大小适口、在水中稳定性好的颗粒药饵投喂，以杀灭水产动物体内的病原体；此法用药量少，使用方便，不污染水体，但只对那些尚有食欲的个体有作用，而对病重者和失去食欲的个体无效；此法适用于预防和治疗。
注射法是用注射器将药物注射入胸腔、体腔或肌肉，以杀灭水产动物体内的病原体；此法用药量准确，吸收快，疗效高，预防效果佳（疫苗、菌苗注射），但操作麻烦，容易损伤机体；此法一般只在繁殖个体、名贵水产动物患病及人工注射疫苗时采用。
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