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呼吸链上具有为辅基的NADH脱氢酶，以为辅基的琥珀酸脱氢酶。

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NADH脱氢酶的作用是催化NADH的个电子传递至辅酶Q，同时将个质子由线粒体基质（M侧）转移至膜间隙（C侧），电子传递的方向为：NADH－－－Q。

琥珀酸脱氢酶的作用是催化电子从转至辅酶Q，但不转移。电子传递的方向为：琥珀酸－－－辅酶Q。

细胞色素c还原酶的作用是催化电子从传给细胞色素c，每转移个电子，同时将个质子由线粒体基质泵至膜间隙。

细胞色素c氧化酶的作用是将从接受的电子传给氧，每转移个电子，在基质侧消耗个质子，同时转移个质子至膜间隙。