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大多数真核mRNA的3'-末端是在切割前体RNA后接着加上一段长200~300个核苷酸的polyA而成的。紧接聚腺苷酸5'-末端上游的AAUAAA序列是多聚腺苷化的主要信号。其重要性已用很多方法验证过。一个简便的方法是利用化学修饰来干扰蛋白与RNA的相互作用。含信号序列的RNA用二乙基焦碳酸盐处理,可使A和G产生乙基碳酸衍生物。这一处理赋予修饰位点在适当情况下对苯胺高度的敏感性,并断裂。如果起始的RNA分子被一端标记,处理后基本上一个分子有一个修饰位点,接着用苯胺去断裂会生成一系列对应于RNA上各个不同A和G位点的片段(如图8-3-29)。(这个方法与DNA化学测序法非常相似)。
为了确定关键的A和G残基,将修饰过的RNA(依旧完整)和能够进行切割及加polyA的细胞抽提液保温。RNA分子接着被分离成polyA+RNA和polyA-RNA。用苯胺处理,琼脂糖电泳后分析片段(第2、3条),第二次反应时在抽提物中加入EDTA,防止有polyA尾巴(对切割没影响),分离切割的分子,苯胺处理后电泳鉴定(第4条)。

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