2000年1月12日，机电公司与机械加工公司签订一份机电设备加工合同，合同约定，机械加工公司于2000年2月底之前为机电公司完成一套机电设备加工任务，部分原材料及加工费总计为66万元，于设备交付后7日内一次性付清，如果一方违约，应向对方支付合同标的额总价10%的违约金。 合同签订后，双方又单独签订一仲裁协议，约定在合同履行过程中，如果就标的物的质量问题发生争议，协商解决不成时，应提交甲仲裁委员会仲裁。合同履行后，就机电设备质量问题双方发生争议。机电公司于2000年5月10日向人民法院起诉，人民法院受理案件后，向被告机械加工公司送达了起诉状副本，并在被告进行实体答辩的情况下对争议案件进行了审理，并作出责令机械加工公司重新加工设备并支付违约金的判决。判决作出后，机械加工公司以存在仲裁协议，人民法院无权受理为由上诉。 请问：